STAT1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3WWT, 1BF5, 1YVL, 2KA6

Ідентифікатори

Символи

STAT1, CANDF7, IMD31A, IMD31B, IMD31C, ISGF-3, STAT91, signal transducer and activator of transcription 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600555 MGI: 103063 HomoloGene: 21428 GeneCards: STAT1

Пов'язані генетичні захворювання

chronic mucocutaneous candidiasis, susceptibility to viral and mycobacterial infections^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • signal transducer activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • tumor necrosis factor receptor binding • double-stranded DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • cadherin binding • histone acetyltransferase binding • GO:0031493 histone binding • ubiquitin-like protein ligase binding • promoter-specific chromatin binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • CCR5 chemokine receptor binding • protein phosphatase 2A binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • нуклеоплазма • ядерце • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • гіалоплазма • аксон • дендрит (нейробіологія) • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • metanephric mesenchymal cell proliferation involved in metanephros development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to interferon-beta • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • metanephric mesenchymal cell differentiation • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • renal tubule development • response to interferon-beta • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • transcription, DNA-templated • negative regulation of endothelial cell proliferation • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • negative regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation • negative regulation of angiogenesis • negative regulation by virus of viral protein levels in host cell • GO:0022415 viral process • endothelial cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of erythrocyte differentiation • type I interferon signaling pathway • cellular response to interferon-gamma • positive regulation of defense response to virus by host • positive regulation of interferon-alpha production • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • defense response to virus • interferon-gamma-mediated signaling pathway • receptor signaling pathway via JAK-STAT • response to nutrient • кровообіг • positive regulation of cell population proliferation • response to mechanical stimulus • GO:1904578 response to organic cyclic compound • cellular response to insulin stimulus • response to cytokine • response to hydrogen peroxide • response to peptide hormone • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • response to cAMP • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • cellular response to cytokine stimulus • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of transcription of Notch receptor target • cytokine-mediated signaling pathway • interleukin-21-mediated signaling pathway • interleukin-6-mediated signaling pathway • interleukin-27-mediated signaling pathway • interleukin-35-mediated signaling pathway • interleukin-9-mediated signaling pathway • defense response • regulation of cell population proliferation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6772


20846

Ensembl


ENSG00000115415


ENSMUSG00000026104

UniProt


P42224


P42225

RefSeq (мРНК)


NM_007315 NM_139266


NM_001205313 NM_001205314 NM_009283 NM_001357627

RefSeq (білок)


NP_009330 NP_644671


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 2: 190.91 – 191.02 Mb

Хр. 1: 52.16 – 52.2 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STAT1 (англ. Signal transducer and activator of transcription 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 750 амінокислот, а молекулярна маса — 87 335^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQWYELQQL	DSKFLEQVHQ	LYDDSFPMEI	RQYLAQWLEK	QDWEHAANDV
SFATIRFHDL	LSQLDDQYSR	FSLENNFLLQ	HNIRKSKRNL	QDNFQEDPIQ
MSMIIYSCLK	EERKILENAQ	RFNQAQSGNI	QSTVMLDKQK	ELDSKVRNVK
DKVMCIEHEI	KSLEDLQDEY	DFKCKTLQNR	EHETNGVAKS	DQKQEQLLLK
KMYLMLDNKR	KEVVHKIIEL	LNVTELTQNA	LINDELVEWK	RRQQSACIGG
PPNACLDQLQ	NWFTIVAESL	QQVRQQLKKL	EELEQKYTYE	HDPITKNKQV
LWDRTFSLFQ	QLIQSSFVVE	RQPCMPTHPQ	RPLVLKTGVQ	FTVKLRLLVK
LQELNYNLKV	KVLFDKDVNE	RNTVKGFRKF	NILGTHTKVM	NMEESTNGSL
AAEFRHLQLK	EQKNAGTRTN	EGPLIVTEEL	HSLSFETQLC	QPGLVIDLET
TSLPVVVISN	VSQLPSGWAS	ILWYNMLVAE	PRNLSFFLTP	PCARWAQLSE
VLSWQFSSVT	KRGLNVDQLN	MLGEKLLGPN	ASPDGLIPWT	RFCKENINDK
NFPFWLWIES	ILELIKKHLL	PLWNDGCIMG	FISKERERAL	LKDQQPGTFL
LRFSESSREG	AITFTWVERS	QNGGEPDFHA	VEPYTKKELS	AVTFPDIIRN
YKVMAAENIP	ENPLKYLYPN	IDKDHAFGKY	YSRPKEAPEP	MELDGPKGTG
YIKTELISVS	EVHPSRLQTT	DNLLPMSPEE	FDEVSRIVGS	VEFDSMMNTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, антивірусний захист, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Schindler C., Fu X.-Y., Improta T., Aebersold R., Darnell J.E. Jr. (1992). Proteins of transcription factor ISGF-3: one gene encodes the 91- and 84-kDa ISGF-3 proteins that are activated by interferon alpha. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 7836—7839. PMID 1502203 DOI:10.1073/pnas.89.16.7836
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yan R., Qureshi S., Zhong Z., Wen Z., Darnell J.E. Jr. (1995). The genomic structure of the STAT genes: multiple exons in coincident sites in Stat1 and Stat2. Nucleic Acids Res. 23: 459—463. PMID 7885841 DOI:10.1093/nar/23.3.459
Fu X.Y. (1992). A transcription factor with SH2 and SH3 domains is directly activated by an interferon alpha-induced cytoplasmic protein tyrosine kinase(s). Cell. 70: 323—335. PMID 1638633 DOI:10.1016/0092-8674(92)90106-M
Wen Z., Zhong Z., Darnell J.E. Jr. (1995). Maximal activation of transcription by Stat1 and Stat3 requires both tyrosine and serine phosphorylation. Cell. 82: 241—250. PMID 7543024 DOI:10.1016/0092-8674(95)90311-9
Li X., Leung S., Kerr I.M., Stark G.R. (1997). Functional subdomains of STAT2 required for preassociation with the alpha interferon receptor and for signaling. Mol. Cell. Biol. 17: 2048—2056. PMID 9121453 DOI:10.1128/MCB.17.4.2048

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з STAT1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11362 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P42224 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма