BHLHA9

BHLHA9
Ідентифікатори
Символи BHLHA9, BHLHF42, basic helix-loop-helix family member a9, CCSPD
Зовнішні ІД OMIM: 615416 MGI: 2444198 HomoloGene: 82363 GeneCards: BHLHA9
Пов'язані генетичні захворювання
mesoaxial synostotic syndactyly with phalangeal reduction[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein dimerization activity
protein heterodimerization activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

multicellular organism development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
727857
320522
Ensembl
ENSG00000205899
ENSMUSG00000044243
UniProt
Q7RTU4
Q5RJB0
RefSeq (мРНК)
NM_001164405
NM_177182
RefSeq (білок)
NP_001157877
NP_796156
Локус (UCSC) Хр. 17: 1.27 – 1.27 Mb Хр. 11: 76.56 – 76.56 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BHLHA9 (англ. Basic helix-loop-helix family member a9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 235 амінокислот, а молекулярна маса — 24 132[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLRGAPGLGLTARKGAEDSAEDLGGPCPEPGGDSGVLGANGASCSRGEAE
EPAGRRRARPVRSKARRMAANVRERKRILDYNEAFNALRRALRHDLGGKR
LSKIATLRRAIHRIAALSLVLRASPAPRGPCGHLECHGPAARGDTGDTGA
SPPPPAGPSLARPDAARPSVPSAPRCASCPPHAPLARPSAVAEGPGLAQA
SGGSWRRCPGASSAGPPPWPRGYLRSAPGMGHPRS

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • McLellan A.S., Langlands K., Kealey T. (2002). Exhaustive identification of human class II basic helix-loop-helix proteins by virtual library screening. Mech. Dev. 119: S285—S291. PMID 14516699 DOI:10.1016/S0925-4773(03)00130-8
  • Phadke S.R., Kar A., Bhowmik A.D., Dalal A. (2016). Complex Camptosynpolydactyly and Mesoaxial synostotic syndactyly with phalangeal reduction are allelic disorders. Am. J. Med. Genet. A. 170: 1622—1625. PMID 27041388 DOI:10.1002/ajmg.a.37643

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з BHLHA9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:35126 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, Q7RTU4 (англ.) . Архів оригіналу за 1 грудня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші