PPARG

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB

1FM6, 1FM9, 1I7I, 1K74, 1KNU, 1NYX, 1PRG, 1RDT, 1WM0, 1ZEO, 1ZGY, 2ATH, 2F4B, 2FVJ, 2G0G, 2G0H, 2GTK, 2HFP, 2HWQ, 2HWR, 2I4J, 2I4P, 2I4Z, 2OM9, 2P4Y, 2POB, 2PRG, 2Q59, 2Q5P, 2Q5S, 2Q61, 2Q6R, 2Q6S, 2Q8S, 2QMV, 2VSR, 2VST, 2VV0, 2VV1, 2VV2, 2VV3, 2VV4, 2XKW, 2YFE, 2ZK0, 2ZK1, 2ZK2, 2ZK3, 2ZK4, 2ZK5, 2ZK6, 2ZNO, 2ZVT, 3ADS, 3ADT, 3ADU, 3ADV, 3ADW, 3ADX, 3AN3, 3AN4, 3B0Q, 3B0R, 3B1M, 3B3K, 3BC5, 3CDP, 3CDS, 3CS8, 3CWD, 3D6D, 3DZU, 3DZY, 3E00, 3ET0, 3ET3, 3FEJ, 3FUR, 3G9E, 3GBK, 3H0A, 3HO0, 3HOD, 3IA6, 3K8S, 3KMG, 3LMP, 3NOA, 3OSI, 3OSW, 3PBA, 3PO9, 3PRG, 3QT0, 3R5N, 3R8A, 3R8I, 3S9S, 3SZ1, 3T03, 3TY0, 3U9Q, 3V9T, 3V9V, 3V9Y, 3VJH, 3VJI, 3VN2, 3VSO, 3VSP, 3WJ4, 3WJ5, 3WMH, 3X1H, 3X1I, 4A4V, 4A4W, 4CI5, 4E4K, 4E4Q, 4EM9, 4EMA, 4F9M, 4FGY, 4HEE, 4JAZ, 4JL4, 4L96, 4L98, 4O8F, 4OJ4, 4PRG, 4PVU, 4PWL, 4R2U, 4R6S, 4XLD, 4R06, 4Y29, 4XTA, 4XUM, 4YT1, 4XUH, 5F9B, 5AZV

Ідентифікатори

Символи

PPARG, CIMT1, GLM1, NR1C3, PPARG1, PPARG2, PPARgamma, peroxisome proliferator activated receptor gamma, PPARG5

Зовнішні ІД

OMIM: 601487 MGI: 97747 HomoloGene: 7899 GeneCards: PPARG

Пов'язані генетичні захворювання

цукровий діабет 2-го типу, familial partial lipodystrophy, цукровий діабет^[1]

Реагує на сполуку

Розиглітазон, ciglitazone, лінолева кислота, месалазин, netoglitazone, Піоглітазон, Троглітазон, farglitazar, індометацин, bexarotene, bardoxolone methyl, диклофенак, Резвератрол^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • alpha-actinin binding • chromatin binding • prostaglandin receptor activity • core promoter sequence-specific DNA binding • enzyme binding • protein phosphatase binding • зв'язування з іоном металу • arachidonic acid binding • nuclear receptor coactivator activity • steroid hormone receptor activity • sequence-specific DNA binding • identical protein binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • double-stranded DNA binding • protein C-terminus binding • zinc ion binding • пептидний зв'язок • protein self-association • retinoid X receptor binding • protein heterodimerization activity • DNA binding domain binding • LBD domain binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • estrogen receptor binding • E-box binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • fatty acid binding • lipid binding • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • perinuclear region of cytoplasm • цитоплазма • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation • epithelial cell differentiation • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • transcription, DNA-templated • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • response to lipid • placenta development • cellular response to vitamin E • negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • negative regulation of sequestering of triglyceride • regulation of fat cell differentiation • cellular response to retinoic acid • glucose homeostasis • negative regulation of collagen biosynthetic process • cellular response to hyperoxia • response to estrogen • regulation of cholesterol transporter activity • regulation of circadian rhythm • negative regulation of telomerase activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to insulin stimulus • monocyte differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of blood pressure • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of fat cell differentiation • negative regulation of cholesterol storage • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell growth • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to prostaglandin stimulus • animal organ regeneration • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • lipoprotein transport • response to metformin • heart development • response to cold • negative regulation of acute inflammatory response • fatty acid oxidation • lipid homeostasis • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • response to vitamin A • вроджений імунітет • response to retinoic acid • cell maturation • cell fate commitment • peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway • ритмічний процес • response to mechanical stimulus • long-chain fatty acid transport • lipid metabolism • response to caffeine • positive regulation of fatty acid oxidation • response to immobilization stress • positive regulation of phagocytosis, engulfment • negative regulation of pancreatic stellate cell proliferation • response to starvation • GO:1904578 response to organic cyclic compound • regulation of lipid metabolic process • steroid hormone mediated signaling pathway • response to organic substance • response to nutrient • cellular response to prostaglandin E stimulus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • white fat cell differentiation • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • G protein-coupled receptor signaling pathway • macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of DNA binding • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of angiogenesis • negative regulation of blood vessel endothelial cell migration • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • GO:1905617 negative regulation of gene silencing by miRNA • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process • negative regulation of vascular endothelial cell proliferation • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • fatty acid metabolic process • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • диференціація клітин • intracellular receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5468


19016

Ensembl


ENSG00000132170


ENSMUSG00000000440

UniProt


P37231


P37238

RefSeq (мРНК)

NM_005037 NM_015869 NM_138711 NM_138712 NM_001330615
NM_001354666 NM_001354667 NM_001354668 NM_001354669 NM_001354670 NM_001374261 NM_001374262 NM_001374263 NM_001374264 NM_001374265 NM_001374266


NM_001127330 NM_011146 NM_001308352 NM_001308354

RefSeq (білок)

NP_001317544 NP_005028 NP_056953 NP_619725 NP_619726
NP_001341595 NP_001341596 NP_001341597 NP_001341598 NP_001341599 NP_001361190 NP_001361191 NP_001361192 NP_001361193 NP_001361194 NP_001361195


NP_001120802 NP_001295281 NP_001295283 NP_035276

Локус (UCSC)

Хр. 3: 12.29 – 12.43 Mb

Хр. 6: 115.34 – 115.47 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PPARG (англ. Peroxisome proliferator activated receptor gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 505 амінокислот, а молекулярна маса — 57 620^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGETLGDSPI	DPESDSFTDT	LSANISQEMT	MVDTEMPFWP	TNFGISSVDL
SVMEDHSHSF	DIKPFTTVDF	SSISTPHYED	IPFTRTDPVV	ADYKYDLKLQ
EYQSAIKVEP	ASPPYYSEKT	QLYNKPHEEP	SNSLMAIECR	VCGDKASGFH
YGVHACEGCK	GFFRRTIRLK	LIYDRCDLNC	RIHKKSRNKC	QYCRFQKCLA
VGMSHNAIRF	GRMPQAEKEK	LLAEISSDID	QLNPESADLR	ALAKHLYDSY
IKSFPLTKAK	ARAILTGKTT	DKSPFVIYDM	NSLMMGEDKI	KFKHITPLQE
QSKEVAIRIF	QGCQFRSVEA	VQEITEYAKS	IPGFVNLDLN	DQVTLLKYGV
HEIIYTMLAS	LMNKDGVLIS	EGQGFMTREF	LKSLRKPFGD	FMEPKFEFAV
KFNALELDDS	DLAIFIAVII	LSGDRPGLLN	VKPIEDIQDN	LLQALELQLK
LNHPESSQLF	AKLLQKMTDL	RQIVTEHVQL	LQVIKKTETD	MSLHPLLQEI
YKDLY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Mukherjee R., Jow L., Croston G.E., Paterniti J.R. Jr. (1997). Identification, characterization, and tissue distribution of human peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) isoforms PPARgamma2 versus PPARgamma1 and activation with retinoid X receptor agonists and antagonists. J. Biol. Chem. 272: 8071—8076. PMID 9065481 DOI:10.1074/jbc.272.12.8071
Lambe K.G., Tugwood J.D. (1996). A human peroxisome-proliferator-activated receptor-gamma is activated by inducers of adipogenesis, including thiazolidinedione drugs. Eur. J. Biochem. 239: 1—7. PMID 8706692 DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.0001u.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Caira F., Antonson P., Pelto-Huikko M., Treuter E., Gustafsson J.-A. (2000). Cloning and characterization of RAP250, a nuclear receptor coactivator. J. Biol. Chem. 275: 5308—5317. PMID 10681503 DOI:10.1074/jbc.275.8.5308
Shao W., Halachmi S., Brown M. (2002). ERAP140, a conserved tissue-specific nuclear receptor coactivator. Mol. Cell. Biol. 22: 3358—3372. PMID 11971969 DOI:10.1128/MCB.22.10.3358-3372.2002
Park U.H., Yoon S.K., Park T., Kim E.J., Um S.J. (2011). Additional sex comb-like (ASXL) proteins 1 and 2 play opposite roles in adipogenesis via reciprocal regulation of peroxisome proliferator-activated receptor {gamma}. J. Biol. Chem. 286: 1354—1363. PMID 21047783 DOI:10.1074/jbc.M110.177816

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PPARG переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Peroxisome proliferator activated receptor gamma переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9236 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P37231 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма