SLAMF1

SLAMF1
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1M27, 1KA7, 1I3Z, 1D4T, 1D4W, 1KA6

Identifiants
AliasesSLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule family 1, CD150
IDs externesOMIM: 603492 MGI: 1351314 HomoloGene: 48162 GeneCards: SLAMF1
Position du gène (Homme)
Chromosome 1 humain
Chr.Chromosome 1 humain[1]
Chromosome 1 humain
Localisation génomique pour SLAMF1
Localisation génomique pour SLAMF1
Locus1q23.3Début160,608,106 bp[1]
Fin160,647,044 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 1 (souris)
Chr.Chromosome 1 (souris)[2]
Chromosome 1 (souris)
Localisation génomique pour SLAMF1
Localisation génomique pour SLAMF1
Locus1 H3|1 79.54 cMDébut171,594,695 bp[2]
Fin171,628,752 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • thymus

  • ganglion lymphatique

  • granulocyte

  • appendice iléo-cæcal

  • sang

  • tonsille

  • cellule de la moelle osseuse

  • rate

  • rectum

  • pancreatic ductal cell
Fortement exprimé dans
  • sang

  • thymus

  • zygote

  • secondary oocyte

  • primary oocyte

  • tibiofemoral joint

  • rate

  • ganglion mésentérique

  • embryon

  • embryon
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison d'antigène
  • virus receptor activity
  • liaison protéique
  • transmembrane signaling receptor activity
  • identical protein binding
  • signaling receptor activity
Composant cellulaire
  • integral component of membrane
  • membrane
  • membrane plasmique
  • région extracellulaire
  • surface cellulaire
  • phagocytic vesicle
  • exosome
  • external side of plasma membrane
Processus biologique
  • adaptive immune response
  • processus du système immunitaire
  • natural killer cell proliferation
  • T-helper 1 cell cytokine production
  • negative regulation of interleukin-6 production
  • positive regulation of JNK cascade
  • adhésion cellulaire
  • negative regulation of CD40 signaling pathway
  • negative regulation of T cell cytokine production
  • myeloid dendritic cell activation involved in immune response
  • regulation of vesicle fusion
  • positive regulation of cell population proliferation
  • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
  • phagocytose
  • activation des lymphocytes
  • pénétration virale
  • negative regulation of tumor necrosis factor production
  • système immunitaire inné
  • regulation of catalytic activity
  • viral process
  • positive regulation of activated T cell proliferation
  • negative regulation of interleukin-12 production
  • natural killer cell differentiation
  • transduction de signal
  • leukocyte chemotaxis involved in inflammatory response
  • positive regulation of macrophage chemotaxis
  • positive regulation of dendritic cell chemotaxis
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

6504

27218

Ensembl

ENSG00000117090

ENSMUSG00000015316

UniProt

Q13291

Q9QUM4

RefSeq (mRNA)

NM_003037
NM_001330754

NM_013730
NM_001360898

RefSeq (protéine)

NP_001317683
NP_003028

NP_038758
NP_001347827

Localisation (UCSC)Chr 1: 160.61 – 160.65 MbChr 1: 171.59 – 171.63 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le SLAMF1 (pour « Signaling lymphocytic activation molecule family 1 ») ou CD150 est une protéine appartenant à la famille des SLAMs. Son gène est SLAMF1 situé sur le chromosome 1 humain.

Rôles

Comme les autres protéines SLAM, il joue un rôle de transduction de signal dans l'immunité.

En médecine

Sa présence est un facteur de bon pronostic en cas de leucémie lymphoïde chronique[5], son absence favorisant l'autophagie[6].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000117090 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015316 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Schweighofer CD, Coombes KR, Barron LL et al. A two-gene signature, SKI and SLAMF1, predicts time-to-treatment in previously untreated patients with chronic lymphocytic leukemia, PLoS One, 2011;6:e28277
  6. Bologna C, Buonincontri R, Serra S et al. SLAMF1 regulation of chemotaxis and autophagy determines CLL patient response, J Clin Invest, 2016;126:181-194
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