MMP2

MMP2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1CK7, 1CXW, 1EAK, 1GEN, 1GXD, 1HOV, 1J7M, 1KS0, 1QIB, 1RTG, 3AYU

Ідентифікатори
Символи MMP2, CLG4, CLG4A, MMP-2, MMP-II, MONA, TBE-1, matrix metallopeptidase 2
Зовнішні ІД OMIM: 120360 MGI: 97009 HomoloGene: 3329 GeneCards: MMP2
Реагує на сполуку
tiludronic acid[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• zinc ion binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0070122 peptidase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• metalloendopeptidase activity
• hydrolase activity
• metallopeptidase activity
• serine-type endopeptidase activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• мембрана
• клітинна мембрана
• саркомера
• extracellular region
• мітохондрія
• клітинне ядро
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• міжклітинний простір
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• intramembranous ossification
• response to hypoxia
• endodermal cell differentiation
• ephrin receptor signaling pathway
• skeletal system morphogenesis
• extracellular matrix disassembly
• bone trabecula formation
• протеоліз
• Ангіогенез
• positive regulation of innate immune response
• collagen catabolic process
• cellular response to amino acid stimulus
• face morphogenesis
• embryo implantation
• blood vessel maturation
• positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation
• cytokine-mediated signaling pathway
• extracellular matrix organization
• GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species
• positive regulation of smooth muscle cell proliferation
• tissue remodeling
• response to amyloid-beta

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4313
17390
Ensembl
ENSG00000087245
ENSMUSG00000031740
UniProt
P08253
P33434
RefSeq (мРНК)
NM_004530
NM_001127891
NM_001302508
NM_001302509
NM_001302510
NM_008610
RefSeq (білок)
NP_001121363
NP_001289437
NP_001289438
NP_001289439
NP_004521
NP_032636
Локус (UCSC) Хр. 16: 55.39 – 55.51 Mb Хр. 8: 93.55 – 93.58 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MMP2 (англ. Matrix metallopeptidase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 660 амінокислот, а молекулярна маса — 73 882[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEALMARGALTGPLRALCLLGCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPKTDKELA
VQYLNTFYGCPKESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKP
RCGNPDVANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQV
WSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTG
VGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDT
GRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGT
SYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCV
FPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLV
AAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPD
IDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR
DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLER
GYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDP
GFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKF
GSIKSDWLGC

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Collier I.E., Bruns G.A.P., Goldberg G.I., Gerhard D.S. (1991). On the structure and chromosome location of the 72- and 92-kDa human type IV collagenase genes. Genomics. 9: 429—434. PMID 1851724 DOI:10.1016/0888-7543(91)90408-7
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Butler G.S., Will H., Atkinson S.J., Murphy G. (1997). Membrane-type-2 matrix metalloproteinase can initiate the processing of progelatinase A and is regulated by the tissue inhibitors of metalloproteinases. Eur. J. Biochem. 244: 653—657. PMID 9119036 DOI:10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00653.x
  • Brooks P.C., Silletti S., von Schalscha T.L., Friedlander M., Cheresh D.A. (1998). Disruption of angiogenesis by PEX, a noncatalytic metalloproteinase fragment with integrin binding activity. Cell. 92: 391—400. PMID 9476898 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80931-9
  • Fernandez-Patron C., Radomski M.W., Davidge S.T. (1999). Vascular matrix metalloproteinase-2 cleaves big endothelin-1 yielding a novel vasoconstrictor. Circ. Res. 85: 906—911. PMID 10559137 DOI:10.1161/01.RES.85.10.906
  • Chattopadhyay N., Mitra A., Frei E., Chatterjee A. (2001). Human cervical tumor cell (SiHa) surface alphavbeta3 integrin receptor has associated matrix metalloproteinase (MMP-2) activity. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 127: 653—658. PMID 11710594 DOI:10.1007/s004320100271

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з matrix metallopeptidase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7166 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P08253 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»