YAF2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2D9G

Ідентифікатори

Символи

YAF2, YY1 associated factor 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607534 MGI: 1914307 HomoloGene: 136401 GeneCards: YAF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of G0 to G1 transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10138


67057

Ensembl


ENSG00000015153


ENSMUSG00000022634

UniProt


Q8IY57


Q99LW6

RefSeq (мРНК)

NM_001012424 NM_001190977 NM_001190979 NM_001190980 NM_005748
NM_001320080


NM_024189

RefSeq (білок)


NP_001177906 NP_001177908 NP_001177909 NP_001307009 NP_005739


NP_077151

Локус (UCSC)

Хр. 12: 42.16 – 42.24 Mb

Хр. 15: 93.18 – 93.23 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

YAF2 (англ. YY1 associated factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 180 амінокислот, а молекулярна маса — 19 901^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDKKSPTRP	KRQPKPSSDE	GYWDCSVCTF	RNSAEAFKCM	MCDVRKGTST
RKPRPVSQLV	AQQVTQQFVP	PTQSKKEKKD	KVEKEKSEKE	TTSKKNSHKK
TRPRLKNVDR	SSAQHLEVTV	GDLTVIITDF	KEKTKSPPAS	SAASADQHSQ
SGSSSDNTER	GMSRSSSPRG	EASSLNGESH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Kalenik J.L., Chen D., Bradley M.E., Chen S.-J., Lee T.-C. (1997). Yeast two-hybrid cloning of a novel zinc finger protein that interacts with the multifunctional transcription factor YY1. Nucleic Acids Res. 25: 843—849. PMID 9016636 DOI:10.1093/nar/25.4.843
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bannasch D., Maedge B., Schwab M. (2001). Functional interaction of Yaf2 with the central region of MycN. Oncogene. 20: 5913—5919. PMID 11593398 DOI:10.1038/sj.onc.1204747
Ogawa H., Ishiguro K., Gaubatz S., Livingston D.M., Nakatani Y. (2002). A complex with chromatin modifiers that occupies E2F- and Myc-responsive genes in G0 cells. Science. 296: 1132—1136. PMID 12004135 DOI:10.1126/science.1069861
Maedge B., Geisen C., Moeroey T., Schwab M. (2003). Yaf2 inhibits Myc biological function. Cancer Lett. 193: 171—176. PMID 12706874 DOI:10.1016/S0304-3835(02)00696-1

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17363 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IY57 (англ.) . Архів оригіналу за 18 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.