UTP4

Ідентифікатори

Символи

UTP4, CIRHIN, NAIC, TEX292, CIRH1A, small subunit processome component, UTP4 small subunit processome component

Зовнішні ІД

OMIM: 607456 MGI: 1096573 HomoloGene: 40775 GeneCards: UTP4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• fibrillar center • ядерце • клітинне ядро • t-UTP complex • хромосома • нуклеоплазма • 90S preribosome • small-subunit processome
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • maturation of SSU-rRNA • transcription, DNA-templated • rRNA processing • ribosome biogenesis • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84916


21771

Ensembl


ENSG00000262788 ENSG00000141076


ENSMUSG00000041438

UniProt


Q969X6


Q8R2N2

RefSeq (мРНК)


NM_032830 NM_001318391


NM_011574 NM_001358982

RefSeq (білок)


NP_001305320 NP_116219


NP_035704 NP_001345911

Локус (UCSC)

Хр. 16: 69.13 – 69.23 Mb

Хр. 8: 107.62 – 107.65 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UTP4 (англ. UTP4, small subunit processome component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 686 амінокислот, а молекулярна маса — 76 890^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEFKVHRVR	FFNYVPSGIR	CVAYNNQSNR	LAVSRTDGTV	EIYNLSANYF
QEKFFPGHES	RATEALCWAE	GQRLFSAGLN	GEIMEYDLQA	LNIKYAMDAF
GGPIWSMAAS	PSGSQLLVGC	EDGSVKLFQI	TPDKIQFERN	FDRQKSRILS
LSWHPSGTHI	AAGSIDYISV	FDVKSGSAVH	KMIVDRQYMG	VSKRKCIVWG
VAFLSDGTII	SVDSAGKVQF	WDSATGTLVK	SHLIANADVQ	SIAVADQEDS
FVVGTAEGTV	FHFQLVPVTS	NSSEKQWVRT	KPFQHHTHDV	RTVAHSPTAL
ISGGTDTHLV	FRPLMEKVEV	KNYDAALRKI	TFPHRCLISC	SKKRQLLLFQ
FAHHLELWRL	GSTVATGKNG	DTLPLSKNAD	HLLHLKTKGP	ENIICSCISP
CGSWIAYSTV	SRFFLYRLNY	EHDNISLKRV	SKMPAFLRSA	LQILFSEDST
KLFVASNQGA	LHIVQLSGGS	FKHLHAFQPQ	SGTVEAMCLL	AVSPDGNWLA
ASGTSAGVHV	YNVKQLKLHC	TVPAYNFPVT	AMAIAPNTNN	LVIAHSDQQV
FEYSIPDKQY	TDWSRTVQKQ	GFHHLWLQRD	TPITHISFHP	KRPMHILLHD
AYMFCIIDKS	LPLPNDKTLL	YNPFPPTNES	DVIRRRTAHA	FKISKIYKPL
LFMDLLDERT	LVAVERPLDD	IIAQLPPPIK	KKKFGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, процесинг рРНК, біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yu B., Mitchell G.A., Richter A. (2005). Nucleolar localization of cirhin, the protein mutated in North American Indian childhood cirrhosis. Exp. Cell Res. 311: 218—228. PMID 16225863 DOI:10.1016/j.yexcr.2005.08.012
Prieto J.L., McStay B. (2007). Recruitment of factors linking transcription and processing of pre-rRNA to NOR chromatin is UBF-dependent and occurs independent of transcription in human cells. Genes Dev. 21: 2041—2054. PMID 17699751 DOI:10.1101/gad.436707
Yu B., Mitchell G.A., Richter A. (2009). Cirhin up-regulates a canonical NF-kappaB element through strong interaction with Cirip/HIVEP1. Exp. Cell Res. 315: 3086—3098. PMID 19732766 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.08.017
Freed E.F., Prieto J.L., McCann K.L., McStay B., Baserga S.J. (2012). NOL11, implicated in the pathogenesis of North American Indian childhood cirrhosis, is required for pre-rRNA transcription and processing. PLoS Genet. 8: E1002892—E1002892. PMID 22916032 DOI:10.1371/journal.pgen.1002892

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1983 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q969X6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.