TFEB

Ідентифікатори

Символи

TFEB, ALPHABHLHE35, TCFEB, transcription factor EB

Зовнішні ІД

OMIM: 600744 MGI: 103270 HomoloGene: 5182 GeneCards: TFEB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• автофагія • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • embryonic placenta development • lysosome organization • адаптивна імунна відповідь • transcription, DNA-templated • positive regulation of autophagy • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • процес імунної системи • humoral immune response • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lysosome localization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7942


21425

Ensembl


ENSG00000112561


ENSMUSG00000023990

UniProt


P19484


Q9R210

RefSeq (мРНК)


NM_001167827 NM_001271943 NM_001271944 NM_001271945 NM_007162


NM_001161722 NM_001161723 NM_011549

RefSeq (білок)


NP_001161299 NP_001258872 NP_001258873 NP_001258874 NP_009093


NP_001155194 NP_001155195 NP_035679

Локус (UCSC)

Хр. 6: 41.68 – 41.74 Mb

Хр. 17: 48.05 – 48.1 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TFEB (англ. Transcription factor EB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 52 865^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASRIGLRMQ	LMREQAQQEE	QRERMQQQAV	MHYMQQQQQQ	QQQQLGGPPT
PAINTPVHFQ	SPPPVPGEVL	KVQSYLENPT	SYHLQQSQHQ	KVREYLSETY
GNKFAAHISP	AQGSPKPPPA	ASPGVRAGHV	LSSSAGNSAP	NSPMAMLHIG
SNPERELDDV	IDNIMRLDDV	LGYINPEMQM	PNTLPLSSSH	LNVYSSDPQV
TASLVGVTSS	SCPADLTQKR	ELTDAESRAL	AKERQKKDNH	NLIERRRRFN
INDRIKELGM	LIPKANDLDV	RWNKGTILKA	SVDYIRRMQK	DLQKSRELEN
HSRRLEMTNK	QLWLRIQELE	MQARVHGLPT	TSPSGMNMAE	LAQQVVKQEL
PSEEGPGEAL	MLGAEVPDPE	PLPALPPQAP	LPLPTQPPSP	FHHLDFSHSL
SFGGREDEGP	PGYPEPLAPG	HGSPFPSLSK	KDLDLMLLDD	SLLPLASDPL
LSTMSPEASK	ASSRRSSFSM	EEGDVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, автофагія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Carr C.S., Sharp P.A. (1990). A helix-loop-helix protein related to the immunoglobulin E box-binding proteins. Mol. Cell. Biol. 10: 4384—4388. PMID 2115126 DOI:10.1128/MCB.10.8.4384
Kuiper R.P., Schepens M., Thijssen J., Schoenmakers E.F.P.M., Geurts van Kessel A. (2004). Regulation of the MiTF/TFE bHLH-LZ transcription factors through restricted spatial expression and alternative splicing of functional domains. Nucleic Acids Res. 32: 2315—2322. PMID 15118077 DOI:10.1093/nar/gkh571
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fisher D.E., Carr C.S., Parent L.A., Sharp P.A. (1991). TFEB has DNA-binding and oligomerization properties of a unique helix-loop-helix/leucine-zipper family. Genes Dev. 5: 2342—2352. PMID 1748288 DOI:10.1101/gad.5.12a.2342
Miller A.J., Levy C., Davis I.J., Razin E., Fisher D.E. (2005). Sumoylation of MITF and its related family members TFE3 and TFEB. J. Biol. Chem. 280: 146—155. PMID 15507434 DOI:10.1074/jbc.M411757200
Najibi M., Labed S.A., Visvikis O., Irazoqui J.E. (2016). An evolutionarily conserved PLC-PKD-TFEB pathway for host defense. Cell Rep. 15: 1728—1742. PMID 27184844 DOI:10.1016/j.celrep.2016.04.052

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11753 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P19484 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.