RNF43

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4KNG

Ідентифікатори

Символи

RNF43, RNF124, URCC, ring finger protein 43, SSPCS

Зовнішні ІД

OMIM: 612482 MGI: 2442609 HomoloGene: 37742 GeneCards: RNF43

Пов'язані генетичні захворювання

рак підшлункової залози^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005110 frizzled binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • nuclear envelope • endoplasmic reticulum membrane • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум • мембрана
Біологічний процес	• negative regulation of Wnt signaling pathway • Wnt signaling pathway • Wnt receptor catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • stem cell proliferation • ubiquitin-dependent protein catabolic process • multicellular organism development
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54894


207742

Ensembl


ENSG00000108375


ENSMUSG00000034177

UniProt


Q68DV7


Q5NCP0

RefSeq (мРНК)


NM_001305544 NM_001305545 NM_017763


NM_172448 NM_001363437

RefSeq (білок)


NP_001292473 NP_001292474 NP_060233


NP_766036 NP_001350366

Локус (UCSC)

Хр. 17: 58.35 – 58.42 Mb

Хр. 11: 87.55 – 87.63 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNF43 (англ. Ring finger protein 43) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 783 амінокислот, а молекулярна маса — 85 722^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGGHQLQLA	ALWPWLLMAT	LQAGFGRTGL	VLAAAVESER	SAEQKAIIRV
IPLKMDPTGK	LNLTLEGVFA	GVAEITPAEG	KLMQSHPLYL	CNASDDDNLE
PGFISIVKLE	SPRRAPRPCL	SLASKARMAG	ERGASAVLFD	ITEDRAAAEQ
LQQPLGLTWP	VVLIWGNDAE	KLMEFVYKNQ	KAHVRIELKE	PPAWPDYDVW
ILMTVVGTIF	VIILASVLRI	RCRPRHSRPD	PLQQRTAWAI	SQLATRRYQA
SCRQARGEWP	DSGSSCSSAP	VCAICLEEFS	EGQELRVISC	LHEFHRNCVD
PWLHQHRTCP	LCMFNITEGD	SFSQSLGPSR	SYQEPGRRLH	LIRQHPGHAH
YHLPAAYLLG	PSRSAVARPP	RPGPFLPSQE	PGMGPRHHRF	PRAAHPRAPG
EQQRLAGAQH	PYAQGWGLSH	LQSTSQHPAA	CPVPLRRARP	PDSSGSGESY
CTERSGYLAD	GPASDSSSGP	CHGSSSDSVV	NCTDISLQGV	HGSSSTFCSS
LSSDFDPLVY	CSPKGDPQRV	DMQPSVTSRP	RSLDSVVPTG	ETQVSSHVHY
HRHRHHHYKK	RFQWHGRKPG	PETGVPQSRP	PIPRTQPQPE	PPSPDQQVTR
SNSAAPSGRL	SNPQCPRALP	EPAPGPVDAS	SICPSTSSLF	NLQKSSLSAR
HPQRKRRGGP	SEPTPGSRPQ	DATVHPACQI	FPHYTPSVAY	PWSPEAHPLI
CGPPGLDKRL	LPETPGPCYS	NSQPVWLCLT	PRQPLEPHPP	GEGPSEWSSD
TAEGRPCPYP	HCQVLSAQPG	SEEELEELCE	QAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sugiura T., Yamaguchi A., Miyamoto K. (2008). A cancer-associated RING finger protein, RNF43, is a ubiquitin ligase that interacts with a nuclear protein, HAP95. Exp. Cell Res. 314: 1519—1528. PMID 18313049 DOI:10.1016/j.yexcr.2008.01.013
Miyamoto K., Sakurai H., Sugiura T. (2008). Proteomic identification of a PSF/p54nrb heterodimer as RNF43 oncoprotein-interacting proteins. Proteomics. 8: 2907—2910. PMID 18655028 DOI:10.1002/pmic.200800083
Chen P.H., Chen X., Lin Z., Fang D., He X. (2013). The structural basis of R-spondin recognition by LGR5 and RNF43. Genes Dev. 27: 1345—1350. PMID 23756651 DOI:10.1101/gad.219915.113

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RNF43 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18505 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q68DV7 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.