PDK1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2Q8F, 2Q8G, 2Q8H

Ідентифікатори

Символи

PDK1, entrez:5163, pyruvate dehydrogenase kinase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602524 MGI: 1926119 HomoloGene: 134437 GeneCards: PDK1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) kinase activity
Клітинна компонента	• mitochondrial pyruvate dehydrogenase complex • мітохондріальний матрикс • клітинне ядро • ядерце • мітохондрія
Біологічний процес	• intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress • фосфорилювання • hypoxia-inducible factor-1alpha signaling pathway • regulation of acetyl-CoA biosynthetic process from pyruvate • regulation of glucose metabolic process • glucose metabolic process • проліферація • protein phosphorylation • carbohydrate metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5163


228026

Ensembl


ENSG00000152256


ENSMUSG00000006494

UniProt


Q15118


Q8BFP9

RefSeq (мРНК)


NM_001278549 NM_002610


NM_172665 NM_001360002

RefSeq (білок)


NP_001265478 NP_002601


NP_766253 NP_001346931

Локус (UCSC)

Хр. 2: 172.56 – 172.61 Mb

Хр. 2: 71.7 – 71.73 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDK1 (англ. Pyruvate dehydrogenase kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 436 амінокислот, а молекулярна маса — 49 244^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLARLLRGA	ALAGPGPGLR	AAGFSRSFSS	DSGSSPASER	GVPGQVDFYA
RFSPSPLSMK	QFLDFGSVNA	CEKTSFMFLR	QELPVRLANI	MKEISLLPDN
LLRTPSVQLV	QSWYIQSLQE	LLDFKDKSAE	DAKAIYDFTD	TVIRIRNRHN
DVIPTMAQGV	IEYKESFGVD	PVTSQNVQYF	LDRFYMSRIS	IRMLLNQHSL
LFGGKGKGSP	SHRKHIGSIN	PNCNVLEVIK	DGYENARRLC	DLYYINSPEL
ELEELNAKSP	GQPIQVVYVP	SHLYHMVFEL	FKNAMRATME	HHANRGVYPP
IQVHVTLGNE	DLTVKMSDRG	GGVPLRKIDR	LFNYMYSTAP	RPRVETSRAV
PLAGFGYGLP	ISRLYAQYFQ	GDLKLYSLEG	YGTDAVIYIK	ALSTDSIERL
PVYNKAAWKH	YNTNHEADDW	CVPSREPKDM	TTFRSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як вуглеводний обмін, обмін глюкози, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мітохондрії.

Література

Gudi R., Bowker-Kinley M.M., Kedishvili N.Y., Zhao Y., Popov K.M. (1995). Diversity of the pyruvate dehydrogenase kinase gene family in humans. J. Biol. Chem. 270: 28989—28994. PMID 7499431 DOI:10.1074/jbc.270.48.28989
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kato M., Li J., Chuang J.L., Chuang D.T. (2007). Distinct structural mechanisms for inhibition of pyruvate dehydrogenase kinase isoforms by AZD7545, dichloroacetate, and radicicol. Structure. 15: 992—1004. PMID 17683942 DOI:10.1016/j.str.2007.07.001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8809 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q15118 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.