LMOD1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4Z79, 4Z8G, 4Z94

Ідентифікатори

Символи

LMOD1, 1D, 64kD, D1, SM-LMOD, SMLMOD, leiomodin 1, MMIHS3

Зовнішні ІД

OMIM: 602715 MGI: 2135671 HomoloGene: 8118 GeneCards: LMOD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • tropomyosin binding
Клітинна компонента	• цитоскелет • мембрана • саркомера • міофібрила • цитоплазма • гіалоплазма • мікрофіламент • striated muscle thin filament
Біологічний процес	• pointed-end actin filament capping • actin nucleation • positive regulation of actin filament polymerization • м'язове скорочення • myofibril assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


25802


93689

Ensembl


ENSG00000163431


ENSMUSG00000048096

UniProt


P29536


Q8BVA4

RefSeq (мРНК)


NM_012134


NM_053106

RefSeq (білок)


NP_036266


NP_444336

Локус (UCSC)

Хр. 1: 201.9 – 201.95 Mb

Хр. 1: 135.25 – 135.3 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LMOD1 (англ. Leiomodin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 600 амінокислот, а молекулярна маса — 67 030^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRVAKYRRQ	VSEDPDIDSL	LETLSPEEME	ELEKELDVVD	PDGSVPVGLR
QRNQTEKQST	GVYNREAMLN	FCEKETKKLM	QREMSMDESK	QVETKTDAKN
GEERGRDASK	KALGPRRDSD	LGKEPKRGGL	KKSFSRDRDE	AGGKSGEKPK
EEKIIRGIDK	GRVRAAVDKK	EAGKDGRGEE	RAVATKKEEE	KKGSDRNTGL
SRDKDKKREE	MKEVAKKEDD	EKVKGERRNT	DTRKEGEKMK	RAGGNTDMKK
EDEKVKRGTG	NTDTKKDDEK	VKKNEPLHEK	EAKDDSKTKT	PEKQTPSGPT
KPSEGPAKVE	EEAAPSIFDE	PLERVKNNDP	EMTEVNVNNS	DCITNEILVR
FTEALEFNTV	VKLFALANTR	ADDHVAFAIA	IMLKANKTIT	SLNLDSNHIT
GKGILAIFRA	LLQNNTLTEL	RFHNQRHICG	GKTEMEIAKL	LKENTTLLKL
GYHFELAGPR	MTVTNLLSRN	MDKQRQKRLQ	EQRQAQEAKG	EKKDLLEVPK
AGAVAKGSPK	PSPQPSPKPS	PKNSPKKGGA	PAAPPPPPPP	LAPPLIMENL
KNSLSPATQR	KMGDKVLPAQ	EKNSRDQLLA	AIRSSNLKQL	KKVEVPKLLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Dong Q., Ludgate M., Vassart G. (1991). Cloning and sequencing of a novel 64-kDa autoantigen recognized by patients with autoimmune thyroid disease. J. Clin. Endocrinol. Metab. 72: 1375—1381. PMID 2026759 DOI:10.1210/jcem-72-6-1375
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Conley C.A., Fritz-Six K.L., Almenar-Queralt A., Fowler V.M. (2001). Leiomodins: larger members of the tropomodulin (Tmod) gene family. Genomics. 73: 127—139. PMID 11318603 DOI:10.1006/geno.2000.6501
Boczkowska M., Rebowski G., Kremneva E., Lappalainen P., Dominguez R. (2015). How Leiomodin and Tropomodulin use a common fold for different actin assembly functions. Nat. Commun. 6: 8314—8314. PMID 26370058 DOI:10.1038/ncomms9314

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6647 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, P29536 (англ.) . Архів оригіналу за 8 березня 2018. Процитовано 18 вересня 2017.