| CD209 |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 1K9I, 1SL4, 1SL5, 2B6B, 2IT5, 2IT6, 2XR5, 2XR6 | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | CD209, CDSIGN, CLEC4L, DC-SIGN, DC-SIGN1, CD209 molecule, hDC-SIGN |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 604672 MGI: 2157948 HomoloGene: 128353 GeneCards: CD209 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • peptide antigen binding
• virus receptor activity
• зв'язування з іоном металу
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• mannose binding
• virion binding
• carbohydrate binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • цитоплазма
• integral component of membrane
• мембрана
• extracellular region
• cell surface
• екзосома
• external side of plasma membrane
• host cell
• клітинна мембрана
|
|---|
| Біологічний процес | • leukocyte cell-cell adhesion
• cell-cell recognition
• GO:0046795 intracellular transport of virus
• regulation of T cell proliferation
• heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
• GO:0007243 intracellular signal transduction
• antigen processing and presentation
• ендоцитоз
• адаптивна імунна відповідь
• процес імунної системи
• viral genome replication
• stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
• peptide antigen transport
• адгезія клітин
• modulation by virus of host process
• viral entry into host cell
• GO:0022415 viral process
• virion attachment to host cell
• вроджений імунітет
• positive regulation of T cell proliferation
• B cell adhesion
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | NM_001144893
NM_001144894
NM_001144895
NM_001144896
NM_001144897
| NM_001144899
NM_021155 |
| |
|---|
| RefSeq (білок) | NP_001138365
NP_001138366
NP_001138367
NP_001138368
NP_001138369
| NP_001138371
NP_066978 |
| |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 19: 7.74 – 7.75 Mb | Хр. 8: 3.9 – 3.9 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CD209 (англ. CD209 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 45 775[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MSDSKEPRLQ | | QLGLLEEEQL | | RGLGFRQTRG | | YKSLAGCLGH | | GPLVLQLLSF |
| TLLAGLLVQV | | SKVPSSISQE | | QSRQDAIYQN | | LTQLKAAVGE | | LSEKSKLQEI |
| YQELTQLKAA | | VGELPEKSKL | | QEIYQELTRL | | KAAVGELPEK | | SKLQEIYQEL |
| TWLKAAVGEL | | PEKSKMQEIY | | QELTRLKAAV | | GELPEKSKQQ | | EIYQELTRLK |
| AAVGELPEKS | | KQQEIYQELT | | RLKAAVGELP | | EKSKQQEIYQ | | ELTQLKAAVE |
| RLCHPCPWEW | | TFFQGNCYFM | | SNSQRNWHDS | | ITACKEVGAQ | | LVVIKSAEEQ |
| NFLQLQSSRS | | NRFTWMGLSD | | LNQEGTWQWV | | DGSPLLPSFK | | QYWNRGEPNN |
| VGEEDCAEFS | | GNGWNDDKCN | | LAKFWICKKS | | AASCSRDEEQ | | FLSPAPATPN |
| PPPA |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Curtis B.M., Scharnowske S., Watson A.J. (1992). Sequence and expression of a membrane-associated C-type lectin that exhibits CD4-independent binding of human immunodeficiency virus envelope glycoprotein gp 120. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 8356—8360. PMID 1518869 DOI:10.1073/pnas.89.17.8356
- Soilleux E.J., Barten R., Trowsdale J. (2000). DC-SIGN, a related gene, DC-SIGNR, and CD23 form a cluster on 19p13. J. Immunol. 165: 2937—2942. PMID 10975799 DOI:10.4049/jimmunol.165.6.2937
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mitchell D.A., Fadden A.J., Drickamer K. (2001). A novel mechanism of carbohydrate recognition by the C-type lectins DC-SIGN and DC-SIGNR. Subunit organization and binding to multivalent ligands. J. Biol. Chem. 276: 28939—28945. PMID 11384997 DOI:10.1074/jbc.M104565200
- Kwon D.S., Gregorio G., Bitton N., Hendrickson W.A., Littman D.R. (2002). DC-SIGN-mediated internalization of HIV is required for trans-enhancement of T cell infection. Immunity. 16: 135—144. PMID 11825572 DOI:10.1016/S1074-7613(02)00259-5
- Nobile C., Moris A., Porrot F., Sol-Foulon N., Schwartz O. (2003). Inhibition of human immunodeficiency virus type 1 Env-mediated fusion by DC-SIGN. J. Virol. 77: 5313—5323. PMID 12692233 DOI:10.1128/JVI.77.9.5313-5323.2003
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1641 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NNX6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
Білки: кластери диференціації |
|---|
| | 1-50 | |
|---|
| | 51-100 | |
|---|
| | 101-150 | |
|---|
| | 151-200 | |
|---|
| | 201-250 | |
|---|
| | 251-300 | |
|---|
| | 301-350 | |
|---|
|
