Tyrocidine

Tyrocidine
Image illustrative de l’article Tyrocidine
Structure de la tyrocidine A
Identification
Nom UICPA cyclo(L-asparaginyl-L-glutaminyl-L-tyrosyl-L-valyl-L-ornithyl-L-leucyl-D-phénylalanyl-L-prolyl-L-phénylalanyl-D-phénylalanyl)
Synonymes

cyclo-(D-Phe-Pro-Phe-D-Phe-Asn-Gln-Tyr-Val-Orn-Leu),
TrcA

No CAS 8011-61-8
PubChem 16129635
ChEBI 29701
SMILES
[H][C@@]1(Cc2ccc(O)cc2)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](Cc2ccccc2)NC(=O)[C@H](Cc2ccccc2)NC(=O)[C@]2([H])CCCN2C(=O)[C@@H](Cc2ccccc2)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCN)NC(=O)[C@@H](NC1=O)C(C)C
PubChem, vue 3D
InChI
Std. InChI : vue 3D
InChI=1S/C66H87N13O13/c1-38(2)32-47-59(85)77-52(36-42-20-12-7-13-21-42)66(92)79-31-15-23-53(79)64(90)76-49(34-41-18-10-6-11-19-41)61(87)74-48(33-40-16-8-5-9-17-40)60(86)75-51(37-55(69)82)62(88)70-46(28-29-54(68)81)58(84)73-50(35-43-24-26-44(80)27-25-43)63(89)78-56(39(3)4)65(91)71-45(22-14-30-67)57(83)72-47/h5-13,16-21,24-27,38-39,45-53,56,80H,14-15,22-23,28-37,67H2,1-4H3,(H2,68,81)(H2,69,82)(H,70,88)(H,71,91)(H,72,83)(H,73,84)(H,74,87)(H,75,86)(H,76,90)(H,77,85)(H,78,89)/t45-,46-,47-,48+,49-,50-,51-,52+,53-,56-/m0/s1
Std. InChIKey :
GSXRBRIWJGAPDU-BBVRJQLQSA-N
Propriétés chimiques
Formule C66H87N13O13
Masse molaire[1] 1 270,476 3 ± 0,065 4 g/mol
C 62,39 %, H 6,9 %, N 14,33 %, O 16,37 %,

Unités du SI et CNTP, sauf indication contraire.
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La tyrocidine est un décapeptide d'origine bactérienne à l'activité antibiotique. Il possède trois particularités : sa circularité fait qu'il est dépourvu d'extrémité N-terminale et d'extrémité C-terminale, il contient un résidu d'ornithine (acide aminé non protéinogène intervenant comme métabolite du cycle de l'urée), et il contient des résidus d'acides aminés D.

Notes et références

  1. Masse molaire calculée d’après « Atomic weights of the elements 2007 », sur www.chem.qmul.ac.uk.
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