Pax6

PAX6
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2CUE, 6PAX

Identifiants
AliasesPAX6
IDs externesOMIM: 607108 MGI: 97490 HomoloGene: 1212 GeneCards: PAX6
Position du gène (Homme)
Chromosome 11 humain
Chr.Chromosome 11 humain[1]
Chromosome 11 humain
Localisation génomique pour PAX6
Localisation génomique pour PAX6
Locus11p13Début31,784,779 bp[1]
Fin31,818,062 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 2 (souris)
Chr.Chromosome 2 (souris)[2]
Chromosome 2 (souris)
Localisation génomique pour PAX6
Localisation génomique pour PAX6
Locus2 E3|2 55.31 cMDébut105,499,245 bp[2]
Fin105,527,709 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • palpebral conjunctiva

  • ventricular zone

  • cellule bêta

  • paraflocculus of cerebellum

  • éminence ganglionnaire

  • Vermis du cervelet

  • right hemisphere of cerebellum

  • pont

  • external globus pallidus

  • Region I of hippocampus proper
Fortement exprimé dans
  • neural layer of retina

  • corneal stroma

  • ventricular zone

  • cristallin

  • épithélium cornéen

  • iris

  • epithelium of lens

  • îlot de Langerhans

  • corps ciliaire

  • conjunctival fornix
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison protéique
  • liaison ADN
  • sequence-specific DNA binding
  • ubiquitin-protein transferase activity
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
  • liaison de chromatine
  • DNA-binding transcription factor activity
  • transcription factor binding
  • protein kinase binding
  • ubiquitin protein ligase binding
  • liaison d'histone acétyltransférase
  • co-SMAD binding
  • R-SMAD binding
  • HMG box domain binding
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • noyau
  • nucléoplasme
  • cytosol
  • intracellulaire
Processus biologique
  • développement de l'œil
  • blood vessel development
  • morphogenèse d'un organe animal
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • glucose homeostasis
  • transcription, DNA-templated
  • central nervous system development
  • response to wounding
  • différenciation cellulaire
  • cornea development in camera-type eye
  • negative regulation of neurogenesis
  • vue
  • iris morphogenesis
  • développent d'un organisme multicellulaire
  • neuron fate commitment
  • Ubiquitination
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • establishment of mitotic spindle orientation
  • cell fate determination
  • migration d'un neurone
  • negative regulation of protein phosphorylation
  • positive regulation of neuroblast proliferation
  • lens development in camera-type eye
  • régionalisation
  • type B pancreatic cell differentiation
  • pancreatic A cell development
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
  • transcription by RNA polymerase II
  • hedgehog
  • axonogenesis
  • Guidage axonal
  • développement cérébral
  • salivary gland morphogenesis
  • negative regulation of cell population proliferation
  • regulation of asymmetric cell division
  • dorsal/ventral axis specification
  • anterior/posterior pattern specification
  • dorsal/ventral pattern formation
  • régulation de l'expression des gènes
  • positive regulation of gene expression
  • pallium development
  • oligodendrocyte cell fate specification
  • cerebral cortex regionalization
  • forebrain dorsal/ventral pattern formation
  • commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain
  • forebrain-midbrain boundary formation
  • telencephalon regionalization
  • pituitary gland development
  • habenula development
  • signal transduction involved in regulation of gene expression
  • keratinocyte differentiation
  • regulation of cell migration
  • positive regulation of epithelial cell differentiation
  • forebrain development
  • lacrimal gland development
  • protein localization to organelle
  • eye photoreceptor cell development
  • camera-type eye development
  • cell fate commitment
  • negative regulation of neuron differentiation
  • régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • regulation of timing of cell differentiation
  • embryonic camera-type eye morphogenesis
  • astrocyte differentiation
  • negative regulation of epithelial cell proliferation
  • régulation de la neurogenèse
  • retina development in camera-type eye
  • cellular response to leukemia inhibitory factor
  • negative regulation of neural precursor cell proliferation
  • positive regulation of core promoter binding
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

5080

18508

Ensembl

ENSG00000007372

ENSMUSG00000027168

UniProt

P26367

P63015

RefSeq (mRNA)
NM_000280
NM_001127612
NM_001258462
NM_001258463
NM_001258464

NM_001258465
NM_001310158
NM_001310159
NM_001310160
NM_001310161
NM_001604

NM_001244198
NM_001244200
NM_001244201
NM_001244202
NM_013627

NM_001310144
NM_001310145
NM_001310146

RefSeq (protéine)
NP_000271
NP_001121084
NP_001245391
NP_001245392
NP_001245393

NP_001245394
NP_001297087
NP_001297088
NP_001297089
NP_001297090
NP_001595
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NP_001355818
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NP_001355820
NP_001355821
NP_001355822
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NP_001355830
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NP_001355832
NP_001355833
NP_001355834
NP_001355835
NP_001355836
NP_001355837
NP_001355838
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NP_001355840
NP_001355841
NP_001355842
NP_001355843
NP_001355844
NP_001355845
NP_001355846
NP_001355847
NP_001355848
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NP_001355852
NP_001355853
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NP_001355855
NP_001355856
NP_001355857
NP_001355858
NP_001355859

NP_001231127
NP_001231129
NP_001231130
NP_001231131
NP_001297073

NP_001297074
NP_001297075
NP_038655

Localisation (UCSC)Chr 11: 31.78 – 31.82 MbChr 2: 105.5 – 105.53 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La protéine paired box 6 (Pax6) est un facteur de transcription notamment impliqué dans le développement des yeux. Elle est codée par le gène PAX6 situé sur le chromosome 11 humain.

Notes et références

  • (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « PAX6 » (voir la liste des auteurs).
  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000007372 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027168 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine


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