IKZF1

IKZF1
Identifiants
AliasesIKZF1
IDs externesOMIM: 603023 MGI: 1342540 HomoloGene: 55948 GeneCards: IKZF1
Position du gène (Homme)
Chromosome 7 humain
Chr.Chromosome 7 humain[1]
Chromosome 7 humain
Localisation génomique pour IKZF1
Localisation génomique pour IKZF1
Locus7p12.2Début50,304,068 bp[1]
Fin50,405,101 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 11 (souris)
Chr.Chromosome 11 (souris)[2]
Chromosome 11 (souris)
Localisation génomique pour IKZF1
Localisation génomique pour IKZF1
Locus11 A1|11 7.02 cMDébut11,635,003 bp[2]
Fin11,722,926 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • leucocyte

  • monocyte

  • moelle osseuse

  • os spongieux

  • sang

  • granulocyte

  • cellule de la moelle osseuse

  • ganglion lymphatique

  • epithelium of nasopharynx

  • thymus
Fortement exprimé dans
  • thymus

  • granulocyte

  • sang

  • ganglion mésentérique

  • rate

  • glande submandibulaire

  • stroma of bone marrow

  • subcutaneous adipose tissue

  • embryon

  • Vésicule vitelline
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • DNA-binding transcription factor activity
  • liaison ADN
  • liaison protéique
  • liaison ion métal
  • Fixation d'acide nucléique
  • protein domain specific binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • noyau
  • nucléoplasme
  • complexe macromoléculaire
Processus biologique
  • erythrocyte differentiation
  • cycle cellulaire
  • développent d'un organisme multicellulaire
  • mesoderm development
  • negative regulation of transcription, DNA-templated
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • transcription, DNA-templated
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • lymphocyte differentiation
  • protein heterooligomerization
  • organisation de la chromatine
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

10320

22778

Ensembl

ENSG00000185811

ENSMUSG00000018654

UniProt

Q13422

Q03267

RefSeq (mRNA)
NM_001220765
NM_001220766
NM_001220767
NM_001220768
NM_001220769

NM_001220770
NM_001220771
NM_001220772
NM_001220773
NM_001220774
NM_001220775
NM_001220776
NM_001291837
NM_001291838
NM_001291839
NM_001291840
NM_001291841
NM_001291842
NM_001291843
NM_001291844
NM_001291845
NM_001291846
NM_001291847
NM_006060

NM_001025597
NM_001301863
NM_001301865
NM_001301866
NM_001301868

NM_009578

RefSeq (protéine)
NP_001207694
NP_001207696
NP_001207697
NP_001207699
NP_001207700

NP_001278766
NP_001278767
NP_001278768
NP_001278769
NP_001278770
NP_001278771
NP_001278772
NP_001278773
NP_001278774
NP_001278775
NP_001278776
NP_006051

n/a

Localisation (UCSC)Chr 7: 50.3 – 50.41 MbChr 11: 11.64 – 11.72 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'IKZF1 (pour « Ikaros Zinc finger protein 1 » est une protéine à doigt de zinc, jouant un rôle de facteur de transcription. Son gène est le IKZF1 situé sur le chromosome 7 humain.

Rôle

Il intervient dans la différenciation des lymphocytes[5]. Il interagit avec le promoteur du gène de la terminal deoxynucleotidyl transferase, favorisant sa transcription[6]. Il se fixe particulièrement sur la zone péri-centromérique des chromosomes[7].

En médecine

Une mutation du gène provoque un type d'hypogammaglobulinémie commune d'expression variable[8].

L'iberdomide favorise la destruction de l'IK7F1[9] et pourrait contribuer, par ce biais, au traitement du lupus érythémateux disséminé[10].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000185811 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000018654 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Yoshida T, Georgopoulos K, Ikaros fingers on lymphocyte differentiation, Int J Hematol, 2014;100:220-229
  6. Lo K, Landau NR, Smale ST, LyF-1, a transcriptional regulator that interacts with a novel class of promoters for lymphocyte-specific genes, Mol Cell Biol, 1991;11:5229-5243
  7. Cobb BS, Morales-Alcelay S, Kleiger G, Brown KE, Fisher AG, Smale ST, Targeting of Ikaros to pericentromeric heterochromatin by direct DNA binding, Genes Dev, 2000;14:2146-2160
  8. Kuehn HS, Boisson B, Cunningham-Rundles C et al. Loss of B cells in patients with heterozygous mutations in IKAROS, N Engl J Med, 2016;374:1032-1043March
  9. Schafer PH, Ye Y, Wu L et al. Cereblon modulator iberdomide induces degradation of the transcription factors Ikaros and Aiolos: immunomodulation in healthy volunteers and relevance to systemic lupus erythematosus, Ann Rheum Dis, 2018;77:1516-1523
  10. Merrill JT, Werth VP, Furie R et al. Phase 2 trial of iberdomide in systemic lupus erythematosus, N Engl J Med, 2022;386:1034-1045
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