Lors de ce tournoi les douze équipes s'affrontent à deux reprises selon un calendrier tiré aléatoirement. Le classement est établi sur le barème de points classique (victoire à 3 points, match nul à 1, défaite à 0). Le départage final se fait selon les critères suivants :
Lors de ce tournoi les douze équipes s'affrontent à deux reprises selon un calendrier tiré aléatoirement. Le classement est établi sur le barème de points classique (victoire à 3 points, match nul à 1, défaite à 0). Le départage final se fait selon les critères suivants :Clausura s'est déroulé de la même façon que les tournois saisonniers précédents, en deux phases :
La qualification pour la Copa Interclubes UNCAF 2004 (en) se faisait de la façon suivante, le finaliste du championnat ayant marqué le plus de points lors de sa phase de qualification se qualifiait pour les quarts de finale et l'autre pour le 1er tour de la compétition.