SnRNA

snRNA (small nuclear RNA, tedy v překladu malá jaderná RNA) je typ nekódující RNA, podílející se na procesu zvaném splicing, při němž dochází k vystříhání intronů z pre-mRNA. Za typ snRNA ovšem mohou být považovány i tzv. snoRNA, které mají poněkud odlišnou funkci.

Funkce

Podrobnější informace naleznete v článku splicing.

snRNA je zajímavá tím, že je schopná katalytické aktivity, což mají v rukou obvykle jen proteiny. Jsou schopné rozeznat na vláknu mRNA místa, kde končí exon a začíná intron, a umožňují tak spolu s několika proteiny vystřihnutí nekódujících sekvencí, jimiž introny jsou.^[1]

Struktura

Na splicingu se podílí velký komplex složený z množství proteinů a RNA, tzv. spliceozom. Jádro spliceozomu tvoří komplexy zvané snRNP (small nuclear ribonukleoprotein). Ty se skládají právě z snRNA a navíc v obvyklém případě asi ze sedmi proteinů.^[1] snRNA je výjimečně bohatá na uridinové nukleosidy.^[2]

Odkazy

Reference

↑ ^a ^b Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Molecular Biology of the Cell, 4rd edition. [s.l.]: [s.n.] Dostupné online.
↑ LORKOVIĆ, Zdravko J., Andrea Barta. Role of Cajal Bodies and Nucleolus in the Maturation of the U1 snRNP in Arabidopsis. PLoS ONE. 2008-12-22, roč. 3, čís. 12, s. e3989. Dostupné online [cit. 2009-02-22]. DOI 10.1371/journal.pone.0003989.

Externí odkazy

Youtube - animace znázorňující procesu splicingu

Tento článek je příliš stručný nebo postrádá důležité informace.
Pomozte Wikipedii tím, že jej vhodně rozšíříte. Nevkládejte však bez oprávnění cizí texty.

Hlavní typy nukleových kyselin

Stavební kameny

Nukleové báze • Nukleosidy • Nukleotidy • Deoxynukleotidy

Obecná charakteristika

Konformace (A-forma, B-forma, Z-forma) • Počet vláken (dsRNA • ssRNA • dsDNA • ssDNA • třívláknová DNA • DNA-RNA vlákna)

Deoxyribonukleová kyselina

genomová DNA (gDNA) • komplementární DNA (cDNA) • chloroplastová DNA (cpDNA) • mitochondriální DNA mtDNA • jednořetězcová DNA o více kopiích (msDNA)

Ribonukleová kyselina


kódující	mediátorová RNA (mRNA) (pre-mRNA/hnRNA) • transferová RNA (tRNA) • ribozomální RNA (rRNA)

RNA interference	mikro RNA (miRNA) • malá interferující RNA (siRNA)

Úpravy RNA	malá jaderná RNA (snRNA) • malá jadérková RNA (snoRNA) • guide RNA

Analogy nukleových kyselin

XNA ( GNA / TNA / HNA ) • LNA • PNA • morpholino

Klonovací vektory

Fagemid • Plasmid • Lambda fág • Kosmid • Fosmid • Umělý chromozom odvozený od fága P1 (PAC) bakterií (BAC) kvasinek (YAC) lidských chromozomů HAC

Typy RNA

Syntéza proteinů	mediátorová RNA (mRNA) ribozomální RNA (rRNA) transferová RNA (tRNA) RNA v signál rozpoznávající částici (7SL RNA) transferová-mediátorová RNA (tmRNA)

Zpracování RNA	malá jaderná RNA (snRNA) malá jadérková RNA (snoRNA) guide RNA (gRNA) RNáza P RNáza MRP Y RNA

Regulace genové exprese	antisense RNA (aRNA) CRISPR RNA dlouhá nekódující RNA (lncRNA) mikroRNA (miRNA) RNA interagující s PIWI (piRNA) siRNA asociovaná s repeticemi (rasiRNA) malá interferující RNA (siRNA) siRNA působící v trans (ta-siRNA) přirozené siRNA působící v cis (cis-NATs)

Regulační elementy na RNA	IRES Riboswitch SECIS element

Parazitické RNA elementy	RNA virus Viroid s mezikrokem v podobě DNA: Retrotranspozon • Retrovirus

Ostatní	telomerázová RNA Vault RNA Subgenomická mRNA (sgRNA)